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聚焦DNA雙鏈斷裂

 

最近,有關(guān)DNA雙鏈斷裂(DSBs)研究成果相繼發(fā)表在頂級(jí)期刊Nature雜志子刊上。首先科學(xué)家提出一種利用全基因組技術(shù)進(jìn)行DNA雙鏈斷裂(DSBs)作圖新方法,相關(guān)研究成果榮登Nature Method雜志。于此同時(shí),Nature雜志另一子刊Nature Neuroscience也刊登了一項(xiàng)成果,講述了引發(fā)DNA雙鏈斷裂的因素。

Nature.Med:全基因組DSB作圖新方法

近日,科學(xué)家提出一種利用全基因組技術(shù)進(jìn)行DNA雙鏈斷裂(DSBs)作圖新方法,這種作圖法以單核苷酸為基本單位,稱之為BLESS(direct in situ breaks labeling, enrichment on streptavidin and next-generation sequencing),相關(guān)研究論文于2013年3月20日在線發(fā)表在Nature Method雜志上。

此項(xiàng)研究由德國法蘭克福歌德大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)研究所 II、美國得克薩斯醫(yī)學(xué)科大學(xué)轉(zhuǎn)化科學(xué)研究院等處研究人員共同完成。

研究人員利用人類和小鼠細(xì)胞以及不同的DNA雙鏈斷裂(DSBs)誘導(dǎo)因子和測(cè)序平臺(tái)對(duì)BLESS法進(jìn)行驗(yàn)證。BLESS能夠識(shí)別端粒末端、SCE核酸內(nèi)切酶誘導(dǎo)的DNA雙鏈斷裂以及復(fù)雜的DSB全基因組。作為一種原理證明,我們讓人類細(xì)胞復(fù)制壓以敏感性基因組為特點(diǎn),確定了> 2,000非均勻分布的阿非迪霉素敏感區(qū)(ASRS),它們中基因過多,富含微衛(wèi)星重復(fù)序列。人類癌癥重排區(qū)也富含ASRS,許多癌癥相關(guān)的基因?qū)?fù)制壓具有極高的敏感性。

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