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西亞試劑:研究解析新型核周轉錄沉默機制

來自美國麻省大學醫(yī)學院,英國牛津大學等處的研究人員發(fā)現(xiàn)DEAD-box家族蛋白中兩個成員:UAP56和Vasa在piRNA生成和功能行使過程中扮演了重要角色,并指出了一種新型核周轉錄沉默機制。相關成果公布在Cell雜志上。

文章的通訊作者分別是麻省大學醫(yī)學院生物信息學和整合生物學部的翁志萍(Zhiping Weng)教授,以及細胞及發(fā)育動態(tài)部的William E. Theurkauf教授。翁志萍早年畢業(yè)于中國科技大學,1997年獲得美國波士頓大學醫(yī)學工程博士學位,翁志萍博士在2003年,她畢業(yè)六年以后,獲聘麻省大學醫(yī)學院終身副教授,她由博士畢業(yè)到成為終身副教授所花費的時間要遠遠少于平均值。當時,她也以32歲的年齡成為波士頓大學歷史上最年輕的具有終身職稱的教授之一。

基因組完整性對于生物體和物的維持均至關重要。而基因組中大量存在的轉座子等DNA移動元件則有可能對生物體遺傳完整性和穩(wěn)定性造成巨大的威脅而引發(fā)基因組突變。盡管有研究表明生物體通常會利用稱為Piwi互作RNAs(piRNAs) 的特異性小RNA分子引導蛋白質去沉默基因組中的轉座子,然而到現(xiàn)在為止科學家對于這一關鍵性的生物系統(tǒng)對應侵入新轉座子的機制還并不是很清楚。

去年翁教授與Theurkauf教授曾發(fā)表Cell文章,揭示了基因組保護自身免受DNA寄生序列入侵的分子機制,他們利用包含新一代測序技術的跨學科方法,獲得了不育的雜交果蠅在不同的發(fā)育階段的全基因組序列。

研究人員發(fā)現(xiàn)一個ATP依賴的RNA解旋酶家族:DEAD-box家族蛋白參與RNA的各種代謝過程如RNA二級結構變換,轉錄起始,線粒體RNA剪接,核糖體和剪接體裝配、mRNA降解以及維持mRNA的穩(wěn)定性等,其中UAP56涉及了mRNA剪接以及輸入,而另外一種DEAD-box蛋白:Vasa則在piRNA生成,定位,與PIWI蛋白Ago3和Aub的結合密切相關。

在最新這篇文章中,研究人員發(fā)現(xiàn)UAP56定位在piRNA基因簇上,并在基因簇轉錄過程中扮演了重要角色,為了驗證這一觀點,研究人員又進行了uap56突變研究,發(fā)現(xiàn)這種突變會阻礙基因簇定位,干擾轉座子沉默機制。

并且Vasa也參與到了這個過程中——研究人員發(fā)現(xiàn)基因組轉錄子即能與Vasa免疫共沉,也能與UAP56發(fā)生作用,因此,研究人員認為這兩者均是piRNA生成過程中,跨越核膜的關鍵作用因子,對于piRNA的功能行使具有重要意義。

此前這一研究組還曾對不育的雜交果蠅在不同的發(fā)育階段的全基因組序列進行分析,發(fā)現(xiàn)在這些雜交果蠅的后代中,新轉座子激發(fā)了一個破壞全部piRNA機制的反應。不僅新導入的轉座子在基因組中跳躍導致了所預期的問題,果蠅基因組中的120多個轉座子中的大多也變得活躍起來。

當這些雜交果蠅長大時,新轉座子和所有存在的固有轉座子均被關閉,生育能力得以恢復。就P因子而言,結果是果蠅學會了處理從父本遺傳的piRNA轉錄物,并將他們轉變?yōu)槌墒斓?piRNAs 來沉默這種轉座子。與之相反的是,固有轉座子跳躍到了piRNA 基因簇中,通過改變其結構,生成新的 piRNAs來沉默固有元件