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來自華東師范大學(xué),日本RIKEN過敏與免疫學(xué)研究中心的研究人員發(fā)現(xiàn)了一種特殊的多功能蛋白:UHRF1在表觀遺傳中的重要作用:能通過靶向DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1,維持DNA甲基化水平,參與H3K9甲基化和DNA甲基化之間的通信。相關(guān)成果公布在《自然—通訊》(Nature Communications)雜志上。
文章的通訊作者是華東師范大學(xué)生命醫(yī)學(xué)研究所翁杰敏教授,第一作者是翁杰敏教授實(shí)驗(yàn)室劉曉麗,高芹芹和李丕順。這一研究組主要研究方向?yàn)榧?xì)胞核激素受體調(diào)控基因表達(dá)的分子機(jī)制和表觀遺傳分子機(jī)制研究,細(xì)胞核激素受體共調(diào)控因子相關(guān)研究曾獲得許多突破性成果,已在國際核心期刊發(fā)表論文近70篇。
哺乳動(dòng)物DNA甲基化表觀遺傳需要一種多功能蛋白:UHRF1,研究證明這種蛋白能通過一種獨(dú)特的半甲基化CpG結(jié)合活性,將DNMT1召集到DNA復(fù)制叉周圍。
圖為UHRF1介導(dǎo)的DNA甲基化酶1補(bǔ)充的運(yùn)行模式
翁杰敏教授指出,UHRF1是目前哺乳動(dòng)物細(xì)胞中所知的唯一一個(gè),既能特異結(jié)合甲基化H3和甲基化CpG的蛋白。其研究組圍繞這種蛋白展開了相關(guān)研究,發(fā)現(xiàn)通過結(jié)合K9甲基化或甲基化DNA, UHRF1能有效定位到異質(zhì)染色體上,并在異質(zhì)染色體的形成與維持中起重要作用。
在此基礎(chǔ)上,這篇文章中研究人員又進(jìn)行了深入實(shí)驗(yàn),他們證明了UHRF1突變?nèi)毕菪停芙Y(jié)合半甲基化CpG或H3K9me2/3,但不能同時(shí)與這兩者結(jié)合)能與臂間異染色質(zhì)( pericentric heterochromatin)相互作用,召集Dnmt1,彌補(bǔ)小鼠Uhrf1缺陷細(xì)胞中部分DNA甲基化缺陷。
此外,研究人員還發(fā)現(xiàn),UHRF1結(jié)合誘導(dǎo)的甲基化胞嘧啶翻轉(zhuǎn),對于其后的DNMT1(DNA甲基轉(zhuǎn)移酶)的甲基化作用并不是必需的。由此研究人員指出,這項(xiàng)研究證明了UHRF1能通過與H3K9me2/3或半甲基化的CpG結(jié)合,靶向DNMT1,用以維持DNA甲基化(DNA maintenance methylation),而且這項(xiàng)研究也表明UHRF1在DNA甲基化維持水平上,參與了H3K9甲基化和DNA甲基化之間的通信。
翁杰敏教授研究組還曾再兩個(gè)組蛋白去甲基化酶(AOF1 和PHF8)的研究工作上取得了突破性進(jìn)展,AOF1是Amine Oxidase家族的一個(gè)成員,該家族成員LSD1是最早發(fā)現(xiàn)的組蛋白去甲基化酶。LSD1的發(fā)現(xiàn)打破了多年來組蛋白甲基化修飾的非可逆性的思想。
翁杰敏教授研究組發(fā)現(xiàn)與LSD1一樣,AOF1也是一個(gè)組蛋白H3K4去甲基化酶,能特異的去除K4一甲基和二甲基,但對K4三甲基化沒有作用(Fig.1和Fig.2)。與LSD1不同之處,AOF1并不與組蛋白去乙酰化酶形成復(fù)合物,但仍具有轉(zhuǎn)錄阻抑作用。我們發(fā)現(xiàn)AOF1的N-末端ZF-CW結(jié)構(gòu)域不僅為AOF1組蛋白去甲基化酶活性所必需,而且也與其轉(zhuǎn)錄阻抑功能密切相關(guān)。這一工作不僅鑒定了一個(gè)新的組蛋白去甲基化酶,而且部分揭示了其作用機(jī)制。(