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西亞試劑 —— 品質(zhì)可靠,值得信賴
近年來,非編碼RNA(即沒有被翻譯成蛋白質(zhì)的RNA)在調(diào)控基因表達中扮演至關(guān)重要的角色已經(jīng)成為一個清楚的事實。對包括microRNA,siRNA等的非編碼RNA的研究更是研究的焦點。這些領(lǐng)域研究的不斷的深入也使我們對基礎(chǔ)生命物質(zhì)有了新的了解、認識。近年來,國內(nèi)外在非編碼RNA方面的研究取得了多項令人矚目的成就。2008年即將來臨之際,美國衛(wèi)生研究院在上周五宣布說,計劃在2008年撥款150萬美元用于研究非編碼RNA和其他轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)機制在成癮過程中的作用。這個資助項目的公布可說是拉開了美國2008年對非編碼RNA熱點資助的序幕。
這項由美國藥物濫用研究所和神經(jīng)科學(xué)、精神健康和成癮研究所管理的經(jīng)費將贊助與神經(jīng)元發(fā)育、神經(jīng)元功能、疾病病因和疾病治療有關(guān)的ncRNA和轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)因子的鑒定了功能研究。欲申請資助的研究項目必須是有助于提高對于藥物濫用和成癮有關(guān)的中樞神經(jīng)系統(tǒng)重ncRNA和轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)因子的了解。NIH指出,盡管對ncRNA的神經(jīng)元功能的研究尚處于起步階段,但是一些ncRNA已經(jīng)被證實能夠調(diào)節(jié)樹突的發(fā)育、神經(jīng)元命運和分化以及突觸蛋白合成。
NIH表示,ncRNA在成癮中可能的作用還不完全清楚,但是ncRNA可能在一些與藥物接觸和藥物依賴性有關(guān)大腦和神經(jīng)元變化中具有重要意義。
非編碼RNA(ncRNA)是近年來發(fā)現(xiàn)的一類能轉(zhuǎn)錄但不編碼蛋白質(zhì)且具有特定功能的RNA小分子。目前的研究顯示,ncRNA的主要功能有:參與mRNA的穩(wěn)定和翻譯水平的調(diào)節(jié)、參與蛋白質(zhì)的運輸、參與RNA的加工和修飾、影響染色體的結(jié)構(gòu)等。目前研究ncRNA但主要方法有:比較基因組生物信息分析發(fā)現(xiàn)ncRNA、分離特定的cDNA克隆用于富集ncRNA、利用芯片系統(tǒng)檢測整個基因組以獲得新轉(zhuǎn)錄物。
國內(nèi)外科研工作者近年來在這個領(lǐng)域取得了多項重大成果。
張雅鷗教授microRNA研究取得新進展
在剛剛結(jié)束的第九屆中國細胞生物學(xué)大會上,來自清華大學(xué)深圳研究生院的女教授張雅鷗報告了她的研究團隊在microRNA(miRNA)的基因結(jié)合位點方面的研究成果。
中科院研究發(fā)現(xiàn)大量新非編碼RNA
來自中科院生物物理所的研究人員對模式生物——線蟲基因組內(nèi)含子中大量非編碼蛋白的小RNA進行了深入的分析。他們確定了100個以前從未發(fā)現(xiàn)過的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,其中包含了2個新的類別。他們的研究進一步了解了線蟲基因組的結(jié)構(gòu)與非編碼RNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),并且更加明確了非編碼RNA在發(fā)育過程中起到重要的作用。這項研究成果發(fā)表在1月的Genome Research上。
利用一種新的、高通量克隆小的全長ncRNA方法,陳教授實驗室成功分離并鑒定出161種轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。采用的新克隆方法在檢測ncRNA上有非常出色的表現(xiàn),比起現(xiàn)有方法檢測效率更高。
在新發(fā)現(xiàn)的161個轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中,100個是從未發(fā)現(xiàn)過的,61個是已知或者預(yù)測到的。在100個新基因中,30個沒有已知功能,另外70個屬于常見的小核RNA(small nucleolar RNA, snoRNA)。根據(jù)測序結(jié)果和結(jié)構(gòu)特征,研究人員對30個未知功能RNA中超過半數(shù)進行了分類,它們可以歸為2個新的類別:柄部突出RNA(stem-bulge RNA, sbRNA)和小核樣RNA(small nuclear-like RNA, snlRNA)。這兩類RNA都在線蟲發(fā)育晚期表現(xiàn)出轉(zhuǎn)錄量上升的趨勢,表明它們可能在這一階段行使功能。
耶魯大學(xué)非編碼RNA最新發(fā)現(xiàn)
去年,美國耶魯大學(xué)的一個研究組研究組發(fā)現(xiàn)一個大的、高度保守的RNA motif,這種RNA motif通常存在于極端革蘭氏陽性真細菌(extremophilic Gram-positive eubacteria)的一種多基因mRNA的一個非編碼部分。
這種類型的RNA采用了一種華麗的二級結(jié)構(gòu),并且只在特定的極端細菌中確定出來。這種華麗、大型、極端(OLE)RNA的長度大約為610個核苷,并且35個典型的核苷酸表現(xiàn)出了非同尋常的核苷酸序列和堿基對的保守性。
對Bacillus halodurans菌中OLE RNA的結(jié)構(gòu)分析驗證了通過比較序列分析預(yù)測到的一種復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)模型。這種結(jié)構(gòu)保守模式和它的獨特的系統(tǒng)發(fā)生分布揭示出OLE RNA只在特定的極端細菌中執(zhí)行一種復(fù)雜和關(guān)鍵的功能。