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微小RNA (microRNA,簡稱miRNA)是生物體內(nèi)源長度約為20-23個核苷酸的非編碼小RNA,通過與靶mRNA的互補(bǔ)配對而在轉(zhuǎn)錄后水平上對基因的表達(dá)進(jìn)行負(fù)調(diào)控,導(dǎo)致mRNA的降解或翻譯抑制。到目前為止,已報道有幾千種miRNA存在于動物、植物、真菌等多細(xì)胞真核生物中,進(jìn)化上高度保守。
一般而言,編碼miRNAs的基因最初產(chǎn)生一個長的pri-RNA分子,這種初期分子還必須被剪切成約70-90個堿基大小、具發(fā)夾結(jié)構(gòu)單鏈RNA前體(pre-miRNA)并經(jīng)過Dicer酶加工后生成。然而近期發(fā)表在Genes & Development(1月1日)的三篇獨(dú)立文章在果蠅中發(fā)現(xiàn)了一種雙向性轉(zhuǎn)錄(bidirectionally transcribed)microRNA,這也許提示了一種新機(jī)制,對于了解miRNA功能的多樣性來說意義重大。
在頭兩篇文章中,來自紐約約斯隆/凱德琳癌癥研究中心(Memorial Sloan-Kettering Cancer Center)發(fā)育生物學(xué)系的賴教授(Eric C. Lai,2007年獲得NHGRI果蠅及線蟲研究項(xiàng)目190萬美元資助,生物谷注)領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)和麻省理工學(xué)院的Manolis Kellis領(lǐng)導(dǎo)的研究小組分別發(fā)現(xiàn)Hox miRNA位點(diǎn)的反義轉(zhuǎn)錄(antisense transcription):miR-iab-4能產(chǎn)生一種新的miRNA前體——mir-iab-8,繼而成為有調(diào)控活性的RNAs。
反義轉(zhuǎn)錄,其產(chǎn)物就是與正義的RNA互補(bǔ)的反義RNA(或者稱反義轉(zhuǎn)錄本),反義RNA可以通過與正義RNA的互補(bǔ)結(jié)合實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄后基因沉默,從而控制基因表達(dá)。在這里發(fā)現(xiàn)的反義轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mir-iab-8在異位表達(dá)(ectopical expressed,生物谷注)的時候,可以通過直接抑制Hox基因靶標(biāo)產(chǎn)生同源異性表型(homeotic phenotype,生物谷注)。
而在第三篇文章中,來自哈佛醫(yī)學(xué)院的Welcome Bender博士則證明了miR-iab-4的敲除揭示了一種從相反鏈轉(zhuǎn)錄的miRNA的存在,而且反義miRNA的缺失會引起一個hox基因的些輕微去抑制(derepression)。
這些在果蠅和哺乳動物中發(fā)現(xiàn)的額外的反義miRNA說明這種新機(jī)制也許能增加科學(xué)家們對miRNA功能的多樣化的了解。
在07年11月份的《Cell》上,來自瑞士日內(nèi)瓦大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)系的研究人員也發(fā)現(xiàn)了一種不依賴于RNAi(RNA干擾)的基因沉默機(jī)制:他們在釀酒酵母中發(fā)現(xiàn)反義RNA穩(wěn)定(Antisense RNA Stabilization)能通過組蛋白去乙酰化引起轉(zhuǎn)錄基因沉默。這些研究都進(jìn)一步揭示了生物體中基因沉默的多樣化。