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北京生命科學(xué)研究所(NIBS)朱冰實(shí)驗(yàn)室在science雜志發(fā)表文章,報(bào)導(dǎo)了DNA復(fù)制過(guò)程中核小體裝配的方式。
真核生物DNA與包括組蛋白在內(nèi)的多種蛋白質(zhì)組裝成為染色質(zhì),染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)給基因功能提供了遺傳信息之外的另一層次的調(diào)控方式。核小體是染色質(zhì)的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)單元,它由DNA與組蛋白八聚體包裝而成,其中H3-H4構(gòu)成組蛋白核心四聚體。組蛋白H3-H4攜帶的一系列穩(wěn)定修飾被認(rèn)為可在有絲分裂細(xì)胞周期中得到繼承,起到表觀遺傳信息的作用,但是這些修飾的繼承方式尚有待研究。想要發(fā)掘組蛋白修飾的繼承機(jī)理,就必須首先澄清DNA復(fù)制過(guò)程中核小體結(jié)構(gòu)的分配模式。
NIBS朱冰實(shí)驗(yàn)室與蛋白質(zhì)中心合作,利用基于穩(wěn)定同位素標(biāo)記的定量技術(shù)對(duì)DNA復(fù)制之后“新”、“舊”組蛋白的分配進(jìn)行研究。作者以可誘導(dǎo)表達(dá)融合FLAG標(biāo)簽的組蛋白H3.1和H3.3的哺乳動(dòng)物細(xì)胞系作為模式體系開(kāi)展實(shí)驗(yàn)。在本項(xiàng)工作中,作者們發(fā)現(xiàn)H3.1-H4組成的核心四聚體在DNA復(fù)制過(guò)程中保持完整。此結(jié)果暗示,新的組蛋白H3.1-H4可能以相鄰核小體的已有修飾為模板,重新建立其修飾模式。作者們還首次發(fā)現(xiàn)由組蛋白變體H3.3組成的H3-H4四聚體會(huì)發(fā)生相當(dāng)量的“新”、“舊”重組。這種重組的生物學(xué)意義值得進(jìn)一步探究。
NIBS博士生徐墨與技術(shù)員龍承祖為本文的共同第一作者,其他作者還有研究生陳秀珍和黃暢。朱冰博士和陳涉博士為文章的共同通訊作者。此項(xiàng)研究由科技部863計(jì)劃和北京市科委資助,在北京生命科學(xué)研究所完成。
論文“Partition of histone H3/H4 tetramers during DNA replication dependent chromatin assembly”引起關(guān)注,science配發(fā)了Geneviève Almouzni博士題名為“Mixing or not mixing”的文章,對(duì)此項(xiàng)工作進(jìn)行了評(píng)論與展望。評(píng)論指出“盡管早期研究認(rèn)為,組蛋白H2A-H2B可以在核小體之間交換而H3-H4四聚體保持穩(wěn)定,但是近年關(guān)于新合成的H3-H4以二聚體形式與histone chaperone組裝的發(fā)現(xiàn)重新激起了爭(zhēng)論”,作者們的研究工作“確鑿了關(guān)于舊的組蛋白H3-H4四聚體保持穩(wěn)定的早期研究”,同時(shí)還發(fā)現(xiàn)“組蛋白變體H3.3與H4形成的四聚體在細(xì)胞周期中可以發(fā)生分裂”。該評(píng)論認(rèn)為“下一步的挑戰(zhàn)在于,探究這些核小體重組模式是如何與組蛋白修飾的繼承方式相關(guān)聯(lián)的”以及“細(xì)胞是如何做出重組與否的選擇,而這種選擇是否在細(xì)胞生命和個(gè)體發(fā)育過(guò)程中被調(diào)控”。(