西亞試劑：兩棲類DNA條形碼通用引物研究獲進(jìn)展

近日，國(guó)際雜志Molecular Ecology Resources刊登了中科院昆明動(dòng)物所車靜副研究員等的最新研究成果“Universal COI primers for DNA barcoding amphibians。”，文章中，研究者在兩棲類DNA條形碼通用引物研究方面取得了新的進(jìn)展。

DNA條形碼技術(shù)（DNA Barcoding）近年來已成為國(guó)際上生物多樣性研究的熱點(diǎn)，即利用標(biāo)準(zhǔn)基因片段對(duì)物種進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的鑒定和識(shí)別。該技術(shù)正廣泛應(yīng)用于生物多樣性調(diào)查、分子進(jìn)化、生態(tài)、環(huán)境、食品安全等諸多領(lǐng)域。

在脊椎動(dòng)物中，目前魚類，鳥類，以及極地動(dòng)物在DNA條形碼研究中進(jìn)展較快，已有大量相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)在線。作為重要類群之一的兩棲爬行動(dòng)物，進(jìn)展一直較為緩慢。在對(duì)兩棲類的研究中，歐洲學(xué)者探討了DNA條形碼的鑒別能力，結(jié)果表明COI基因在該類群中鑒別物種方面是適合的，但是由于COI基因進(jìn)化速率較快，序列保守性相對(duì)低，引物通用性差，極大阻礙了在全球兩棲類群中開展相關(guān)工作。

中科院昆明動(dòng)物所車靜副研究員以及學(xué)生陳宏滿和楊軍校等人在張亞平院士的指導(dǎo)下，重新設(shè)計(jì)和優(yōu)化了兩對(duì)COI通用兼并引物，在中國(guó)兩棲類的11個(gè)科、36個(gè)屬、82個(gè)種111個(gè)個(gè)體中進(jìn)行了驗(yàn)證，證實(shí)新設(shè)計(jì)的兩對(duì)引物能夠較廣泛的用于兩棲類DNA條形碼研究。該結(jié)果目前已在線發(fā)表Molecular Ecology Resources。該引物目前在爬行類群測(cè)試中也得到很好的驗(yàn)證。

兩棲爬行類是動(dòng)物界中獨(dú)特的一支，尤其兩棲類代表由水到陸的轉(zhuǎn)型過渡物種，對(duì)環(huán)境變化極為敏感，一直是研究環(huán)境和氣候變化的指示物種。針對(duì)兩棲爬行類DNA條形碼工作不足的現(xiàn)狀，昆明動(dòng)物所于第四屆國(guó)際生命條形碼大會(huì)上提出兩棲爬行動(dòng)物DNA條形碼“Cold Code”計(jì)劃，致力于在全球范圍內(nèi)領(lǐng)導(dǎo)兩棲爬行類標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)記基因篩選、技術(shù)體系構(gòu)建、標(biāo)準(zhǔn)文庫(kù)建設(shè)等方面發(fā)揮重要作用。

本研究得到了科技部基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)、基金委重大項(xiàng)目、中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程項(xiàng)目等的支持